Hirudin sudaro 65 amino rūgštys

Hirudinas yra mažos molekulinės masės (7000) polipeptidas, sudarytas iš 65 aminorūgščių, tarp kurių glutaminas ir šparaginas turi aukštesnį buhalterį, o izoelektrinis taškas yra mažesnis (3,8-4,0), ir jis ilgą laiką yra stabilus kambario temperatūroje. Hirudinas yra efektyviausias žinomas natūralus antikoaguliantas, o jo poveikis yra geresnis nei heparinas. Jis turi antikoaguliantų ir trombus tirpinantį poveikį, kuris yra kraujotakos skatinimo ir kraujo stazės pašalinimo kinų medicinoje funkcija. Todėl tai rodo didelį pranašumą ir plačias perspektyvas kovojant su tokiomis ligomis kaip septinis šokas, aterosklerozė, smegenų kraujagyslių infarktas, širdies ir kraujagyslių ligos, hipertenzija, oftalmologija ir įvairios ligos, neturinčios antitrombino.